从乌岭撤退，转而驻扎在釜山浦。
刘綎与祖承训等人随后率领军队进兵屯驻大丘、忠州，并利用全罗水军在釜山海口布设防线，有效地遏制了日本军队的攻势，朝鲜的局势因此得到了初步的稳定。
不久之后，明军将领李如松命令刘綎屯兵陕川，以防范日本军队可能的反扑。在刘綎的带领下，明军在这一地区取得了一系列胜利。随着战局的发展，日本军队迫于压力，不得不将朝鲜王子送回朝鲜，以示和解之意。见此情况，明神宗下令大部分明军撤回国内，仅留下刘綎和吴惟忠共计七千六百人，分别扼守朝鲜各地的重要军事要地。
六、贿赂转官
播州土着首领杨应龙叛乱之后，明政府面临严峻的边疆安全问题。为了应对这一危机，朝廷决定提拔刘綎为四川总兵官，以增强当地的力量，镇压叛乱。然而，在这个关键时刻，刘綎试图通过非正式手段获得更高的官职和荣誉。
为了达到目的，刘綎私下里贿赂了御史宋兴祖，希望后者能够帮助他在朝廷中推动自己的功绩得到更高的评价，并借此机会获得破格提拔。然而，这种不正当的行为并没有逃脱朝廷的监察。宋兴祖意识到事情的严重性，决定将此事上报给上级官员。
按照当时的法律规定，刘綎的这种行为应当受到革职的处罚。吏部在接到报告后，对此事进行了讨论。考虑到刘綎过去在抗击缅甸和朝鲜战争中的出色表现以及对国家做出的重大贡献，吏部决定采取较为宽容的态度。最终，吏部建议革除刘綎在云南时加封的所有官阶，并保留其副总兵的职位，以副总兵的身份镇守四川。
就在这个时候，杨应龙提出愿意停战求和，而青海地区盗匪的活动也日益猖獗。为了更好地应对这些新的挑战，朝廷决定特设临洮总兵官一职，并调任刘綎担任这一重要职务。这一举措不仅解决了当时的政治难题，也给了刘綎一个弥补错误的机会，让他有机会继续为国家服务。
七、复征朝鲜
1597年（万历二十五年）五月，第二次朝鲜战争爆发。为了应对日本的再度入侵，万历皇帝下诏任命刘綎为防御倭寇的总兵官，提督汉人和土着士兵前往朝鲜作战。刘綎直到次年二月才抵达朝鲜，此时杨镐和李如梅已经遭受了战败。
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为了重新组织攻势，经略邢玠将部队分成三个部分，由董一元指挥中军，麻贵负责东路，而西路则由刘綎指挥。此外，陈璘专门负责指挥水军。刘綎在水源扎营，而日本军队也分兵三路，其中小西行长据守顺天，挖掘深沟并加固了防御工事。
刘綎计划诱捕小西行长，他派出使者与小西行长约定会面的时间。使者三次往返，每次刘綎都会独自骑马在约定地点等候，以此来迷惑小西行长。小西行长通过侦察得知这一情况，误以为刘綎真的打算会面，于是同意在八月初一进行会面。
然而，在约定的日期之前，刘綎部下的某人不慎泄露了这一计谋，小西行长得知后大吃一惊，迅速逃离了顺天。刘綎的诱敌计划因此未能成功。监军参政王士琦对刘綎的失误表示不满，想要将其捆绑至中军营接受责罚。刘綎意识到情况不妙，于是极力督战，最终成功攻破敌营，迫使敌人退却，不敢再出战。
随后，各将领分三路出击，刘綎在挑战中获胜，将敌人驱逐进了大城中。不久，敌人得知丰臣秀吉去世的消息，开始准备撤退。刘綎趁夜色攻取了粟林和曳桥，取得了重大的战果。石曼子率领水军前来救援，但在中途被陈璘指挥的水军在海上击败。小西行长随后放弃了顺天，乘坐小船逃离。
八、播州之役
1600年（万历二十八年），因朝鲜之战中的杰出表现，朝廷提升刘綎为都督同知，并世代荫封千户职。为了平定播州土着首领杨应